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IPlant unira collaboration entre les disciplines scientifiques

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Cold Spring Harbor Laboratory (CSHL) jouera un rôle central dans une nouvelle initiative importante appelée iPlant collaborative, financé par la National Science Foundation (NSF). La collaboration permettra de définir et de l'adresse "grand défi questions" en biologie végétale qui ont des implications mondiales.

"L'idée est de développer un tout englobant l'informatique basée sur Internet et l'infrastructure qui permettront de transformer la façon dont les sciences végétales est fait, et qui sera accessible, à différents niveaux, par des scientifiques dans toutes les disciplines et à travers la planète», a expliqué Lincoln Stein, Ph.D., professeur CSHL et co-investigateur principal de la collaboration. "En outre, le programme sera une ressource précieuse pour les étudiants et les membres intéressés du public."

CSHL et quatre universités de recherche, conduit par l'Université de l'Arizona, se partageront un montant de 50 $ millions NSF subvention sur cinq ans pour lancer le iPlant collaboratif. Elle rassemblera des chercheurs de tous les secteurs de la biologie végétale - biologistes moléculaires et cellulaires, les généticiens, le génome des scientifiques, ainsi que des experts sur les écosystèmes et la diversité biosystème - en construisant une infrastructure grâce à laquelle ils peuvent plus facilement interagir et collaborer.

Comme la recherche se fait en temps réel ainsi que des «hors ligne», en liaison avec des mathématiciens, des informaticiens et des ingénieurs, des experts en informatique, et même des sciences sociales, des biologistes végétaux peuvent être certains que les outils disponibles à travers le réseau iPlant reflétera les connaissances les plus récentes . "Cela reflète la manière dont la science se fait dans le 21ème siècle", dit Rob MARTIENSSEN, Ph.D., professeur et chef de la génétique des plantes, à CSHL. «Les jours ont longtemps révolu où il était logique pour les scientifiques, ou des laboratoires, ou même une institution, à l'attaque grandes questions scientifiques isolément de l'ensemble de la communauté."

La collaboration entre les disciplines dans la poursuite des avancées scientifiques - par exemple, le génome végétal experts travaillant côte-à-côte avec des mathématiciens et statisticiens d'interpréter les résultats des scans innovantes microréseaux génomiques de mutations biologiques conçus par des ingénieurs - est déjà la norme dans la communauté scientifique de la plante Et dans les sciences de la vie.

«Mais», souligne le Dr Stein, bio-informatique dont les outils sont largement utilisés par les scientifiques du monde entier du génome ", la dimension qui fait défaut, et pour la collaboration qui vise à résoudre, concerne l'établissement d'une communauté fonctionnelle, au sein de la discipline et d'étendre à ceux En informatique, des mathématiques et d'autres domaines, dont l'expertise sur les sciences végétales dépend ».

CSHL, à travers ses Dolan DNA Learning Center (DNALC), collaborera avec l'équipe du projet pour intégrer des documents de sensibilisation au sein de la iPlant portail, ainsi étroitement lier la recherche sur les plantes et l'éducation. Ces ressources peuvent être des podcasts audio et vidéo pour faire connaître le projet et de fournir aux étudiants et aux enseignants une fenêtre sur le "grand défi" processus de développement.

Le DNALC travailleront avec les chercheurs à mettre au point des plantes interviews vidéo et raconté des animations qui expliquent le contexte conceptuel et historique de développement de chaque "grand défi." Le point culminant de ce qui se frayer un programme national qui formera 1000 enseignants de sciences dans la manière d'utiliser les outils pour iPlant étudiant des projets favorisant la réflexion intégrative et computationnelle.

"L'enseignement des sciences et de la sensibilisation du public en général commence bien après une révolution scientifique s'est installé dans ce que Thomas Kuhn appelle la science normale. Dans ce projet, nous voulons associer directement les étudiants et les enseignants dans cette période révolutionnaire de la recherche sur les plantes en leur fournissant des interfaces en éducation Les mêmes données utilisées par les scientifiques iPlant ", a déclaré David Micklos, Ph.D., Directeur exécutif de l'DNALC.

Le iPlant de collaboration a été formé à la suite d'un appel de propositions en 2006, de la NSF's Department of Biological infrastructure. CSHL sera l'hôte de la collaboration de la réunion inaugurale, prévue pour avril 2008, ainsi que d'autres réunions tout au long de la période de cinq ans de la NSF subvention.

"Il s'agit d'une perspective passionnante qui rappelle les quelques autres prospectives moments de l'histoire récente de la recherche biologique dans lequel CSHL était très impliqué", a déclaré M. Martinssen. "C'est sur notre campus que l'idée pour le séquençage du génome de la première plante vu le jour, et où les contours de ce qui est devenu le Projet du génome humain ont d'abord été esquissées. Nous espérons que la collaboration sera également iPlant réaliser de grandes choses."

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Article adapté par Medical News Today de l'original du communiqué de presse.
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CSHL est un organisme privé sans but lucratif de recherche et d'enseignement dédié à l'exploration institution de la biologie moléculaire et la génétique, afin de faire progresser la compréhension et la capacité à diagnostiquer et traiter les cancers, les maladies neurologiques, et d'autres causes de la souffrance humaine.

Pour de plus amples renseignements, visitez http://www.cshl.org/.

Source: Jim Bono
Cold Spring Harbor Laboratory

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