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Grid Computing offre un nouvel espoir dans la course contre la grippe aviaire

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Mois dernier d'une collaboration entre des chercheurs européens et asiatiques ont lancé une nouvelle attaque meurtrière contre le virus de la grippe aviaire, en exploitant la puissance combinée de plus de 40000 ordinateurs à travers 45 pays pour stimuler le rythme de découverte de médicaments anti virales.

Appelé Enabling Grids for E-sciencE, la grille de calcul des PC se connecte ordinaire pour former un super sized supercalculateur qui est utilisé au cours de ce défi pour analyser le potentiel de plus de 500000 molécules comme des drogues au cours des prochaines semaines.

Cet effort vient que de nouvelles données rendues publiques la semaine dernière par l'Université de Pékin à Pékin, en Chine, montre que le virus de la grippe aviaire H5N1 peut passer à travers le placenta des femmes enceintes au foetus à naître, et peut infecter d'autres organes que les poumons chez l'adulte. Une réponse rapide à toute apparition de la pandémie du virus serait essentiel de son contrôle.

Dr Wu Ying-Ta, biologiste au Centre de recherche en génomique de l'Academia Sinica, explique les grilles de calcul comme l'EGEE est la plus rapide et la moins chère pour découvrir de nouveaux médicaments potentiels.

«Nous utilisons EGEE pour trouver de nouvelles molécules qui peuvent inhiber les activités du virus de la grippe", le Dr Wu Ying-Ta explique: «Au cours de précédents défis en utilisant la grille EGEE, nous avons découvert environ 200 molécules ayant le potentiel de devenir des médicaments contre la grippe aviaire."

La grille de calcul EGEE pouvoirs drug discovery logiciel qui permet aux chercheurs de calculer la probabilité qu'un médicament va-comme molécule active quai avec les sites sur le virus et ainsi inhiber son action. En utilisant les résultats d'une telle in silico de dépistage, les chercheurs peuvent prédire quels composés sont les plus efficaces pour bloquer le virus. Cela accélère la découverte de nouveaux inhibiteurs puissants en minimisant la non-productifs par essais et erreurs dans un laboratoire.

"La grippe aviaire reste une menace pour la santé dans le monde et nous sommes bien conscients que tout pandémie pourrait se propager rapidement à travers l'Europe" a déclaré Viviane Reding, Commissaire européenne pour la société de l'information et des médias. «Je suis heureux que le projet européen EGEE a trouvé un rôle si important pour l'application des technologies de grille informatique en accélérant la découverte de médicaments contre les maladies négligées et émergentes. Collaboration entre l'Europe et l'Asie est essentielle si nous voulons aborder le monde des menaces pour la santé publique" .

Lors de la conférence de Budapest EGEE'07, Ulf Dahlsten, directeur de «Technologies émergentes et Infrastructures" dans la société de l'information et médias Direction générale de la Commission européenne, l'exemple de la réussite de l'EGEE de la grippe aviaire afin d'illustrer l'apport potentiel de l'e - Infrastructures à la science. "Computer grilles ont atteint un accroissement de la productivité de plus de 6000% dans l'identification de nouveaux médicaments" at-il dit. «300000 molécules ont déjà été examinés en utilisant la grille d'EGEE. Sur ce total, 123 des inhibiteurs potentiels ont été recensés, dont sept ont désormais été démontré à agir comme inhibiteurs in vitro dans des tests de laboratoire. Il s'agit d'un taux de réussite de six pour cent par rapport aux valeurs typiques De l'ordre de 0,1 pour cent en utilisant les méthodes classiques de découverte de médicaments. "

EGEE-GRIDS POUR PERMETTRE LA SCIENCE E-
CERN
1211 Genève 23
Http://www.eu-egee.org

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